未经处理的原水中含有很多细菌杂质，反渗透膜在处理这些杂质的过程中，微生物会随着水中营养物质在膜内富集，软化水，从而污染膜。反渗透膜被污染会严重影响设备性能、工作效率以及水处理和出水品质。陶氏反渗透膜元件进出口压差快速增大，导致膜元件产水量降低。甚至有时产水侧会出现生物污染，导致产水被再次污染。
陶氏反渗透膜元件一旦出现微生物污染并产生生物膜，那我们对反渗透膜的清洗就会非常困难。此外，没有完全除去的生物膜会引起微生物再次滋生，而且速度非常快。因此在预处理过程中，对于微生物的控制也是十分重要的，反渗透，尤其是以海水、地表水和废水作为水源的反渗透预处理系统。
防止陶氏反渗透膜微生物污染的主要方法有加氯、超滤、臭氧氧化以及紫外线sha菌等。火电厂水处理系统常采用加氯以及超滤预处理技术。
氯气作为一种sha菌剂，能够使很多有害微生物失去活性。氯的sha菌效率主要取决于其浓度、水的PH值以及反应时间。在反渗透系统中，水中余氯维持在0.5～1.0mg/L以上，反应时间在20-30分钟。氯的投加量需要通过反复调试确定，因为水中其他有机物也会消耗氯气。采用氯气sha菌，就好将PH值控制在4-6佳。由于陶氏反渗透膜元件对进水的余氯量有特殊要求，因此采用氯气sha菌后，净水，还要进行脱氯处理。
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