所有的原水均含有微生物:即细菌、藻类、真菌、病毒和其它高等生物。细菌的一般尺寸为 1~3mm,微生物可以看成是胶体物质,可以按防止胶体污染一节讨论的预处理方法进行除去,但它与无生命的颗粒不同之处在于他们有繁殖能力,水处理,在适宜的生存条件下形成生物膜。

陶氏膜
微生物进入反渗透系统之后,软水,找到了水中溶解性的有机营养物,这些有机营养物伴随反渗透过程的进行而浓缩富集在膜表面上,成为形成生物膜的理想环境与过程。膜元件的生物污染将严重影响反渗透系统的性能,出现进水至浓水间压差的迅速增加,导致陶氏膜元件发生“望远镜”现象与机械损坏以及膜产水量的下降,有时甚至在膜元件的产水侧也会出现生物污染,导致产品水受污染。

陶氏膜
一旦出现生物污染并产生生物膜,清洗就非常困难。因为生物膜能保护微生物受水力的剪切力影响和化学品的消毒作用,水处理,此外,没有被彻底清除掉的生物膜将引起微生物的再次快速的滋生。因此微生物的防治是预处理过程中主要的任务。地表水比井水出现生物污染的机会要多得多,这就是为什么地表水、海水、废水更难处理的主要原因。

陶氏膜
陶氏膜的生物膜检测
未经处理的原水、膜装置进水和浓水中的微生物含量是评估潜在生物污染的重要指标。但其它因素如营养成份的浓度和种类、操作参数也决定了生物膜的发展,某些研究者开展生物膜形成的研究表明,人们还没有充分认识清楚生物膜,早期确认产生生物膜的好办法是观察进水中试样的表面,即所谓“Robbin 试样”,它是将小型试样置于水样中的一个简单的装置,这些安置在表面的试样可以按一定时间间隔移走,检查所附着的细菌情况。实际系统操作过程中,定期仔细地检查保安滤器滤芯以及进水和浓水管内表面,也是有效的做法,当出现粘泥和异味时就表明有微生物污染。
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