荷电性
纳滤膜的荷电性是纳滤膜重要特征之一，这种影响1911年被发现并首先用于解释离子交换膜的原理。荷电性与膜材料以及制造工艺等相关联，荷电与否、荷电种类、材料及荷电的强度对膜性能影响较大，荷电对纳滤膜抗污染性能也有一定的影响。
新型纳滤膜大多具有一定的电荷(往往带负电)，导致纳滤膜的截留机理不同于传统的软化纳滤膜的机械筛分机理，其加入了膜与无机物阳离子，膜与有机物的电性作用。
对无机物的分离特性
纳滤膜对无机离子的去除介于反渗透膜和超滤膜之间，它对不同的无机离子有不同的分离特性，这是纳滤膜与反渗透膜分离性能的主要差别。
NaCl的截留率与溶液的浓度有很大关系，当溶液浓度由0.05mol/L增至1mol/L时，NaCl的截留率由45%降至7%。在用纳滤膜处理含大量金属离子的溶液时发现Cd、Zn、Pb、Cr等离子的截留率大于90%，净水，而K、Na等离子的截留率则小于10%。
对有机物的分离特性
纳滤膜一般对分子量在200以上的有机物具有较好的分离效果，去除率大于90%，基于此提出纳滤膜截留分子量为200-500，但有些文献认为纳滤膜截留分子量的范围可为200-1000，甚至200-2000。在同样的操作条件下，纳滤膜对憎水性的有机物去除效果好(97.5%以上)，而亲水性的有机物一般为小分子有机物，可以较顺利地与水分子一起透过纳滤膜，从而说明纳滤膜对有机物去除的选择性。
二、影响纳滤膜分离特性的因素
共离子
纳滤膜对离子的截留率受到共离子的强烈影响，对同一种膜而言，反渗透，在分离同种离子并在该离子浓度恒定条件下，共离子价数相等，共离子半径越小，膜对该离子的截留率越小，共离子价数越高，膜对该离子的截留率越高。纳滤膜对二价离子的截留率较一价离子截留率高得多，主要是由于离子半径和静电斥力作用影响造成的。
操作条件
操作条件对纳滤膜的分离性能有直接影响，操作压力的提高可提高水通量和脱盐率，回收率的提高可降低水通量和脱盐率，料液速率的提高可提高水通量和脱盐率。纳滤膜的耐压密性好，水通量和截留率随操作时间延长基本不变，对分子量数百的有机小分子和高价离子有较高的脱除率。
其它条件
由于道南离子效应的影响，物料的荷电性，软水，离子价数，离子浓度，溶液pH值等对纳滤膜的分离效率有一定的影响。
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